A infra-estrutura está dividida em três áreas distintas: administrativa, veterinária e canil-gatil. No corpo principal do edifício localiza-se o átrio de entrada, onde são recebidos os animais abandonados e onde é feito o controlo de entrada do edifício, a área de recepção, o gabinete administrativo e a sala de reuniões.
Relativamente ao canil propriamente dito, este contempla um total de 37 boxes caninas, entre as quais quatro com carácter de isolamento e três de maternidade. A área do gatil conta com 16 boxes, das quais duas são de isolamento e duas para maternidade.
A inauguração foi feita por Alberto João Jardim, presidente do Governo Regional da Madeira e Roberto Silva, presidente da Câmara Municipal do Porto Santo.